trimethylamine degradation
三甲胺降解
經過trimethylamine oxide aldolase三甲胺氧化物醛縮酶(也就是TMAO demethylase-TMAO脫甲基酶(Tdm))
變成formaldehyde甲醛及dimethylamine二甲胺
二甲胺再經過dimethylamine monooxygenase二甲胺單加氧酶
變成formaldehyde甲醛和methylamine甲胺
Finally, methylamine can be converted to formaldehyde and ammonia via different pathways,depending on the organism (see methylamine degradation I and methylamine degradation II).
最後,甲胺可以通過不同的途徑轉化為甲醛和氨,這取決於生物體(參見甲胺降解I和甲胺降解II)。
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甲胺透過methylamine dehydrogenase甲胺脫氫酶變成formaldehyde甲醛
(https://biocyc.org/META/NEW-IMAGE?type=PATHWAY&object=PWY-6967)
甲胺也可以透過glutamate methylamine ligase谷氨酸甲胺連接酶,再經過N-methyl-L-glutamate synthase
N-甲基-L-谷氨酸合酶變成ammonium氨及N-methyl-L-glutamateN-甲基-L-谷氨酸;
N-methyl-L-glutamateN-甲基-L-谷氨酸再經過N-methyl glutamate dehydrogenaseN-甲基谷氨酸脫氫酶
變成formaldehyde甲醛
甲醛代謝
一、
Trimethylamine N-oxide (TMAO)
三甲胺N-氧化物(TMAO)
We show here that the enzyme TMAO demethylase (Tdm) catalyzes the first step
in TMAO degradation.
我們在此顯示酶TMAO脫甲基酶(Tdm)催化TMAO降解的第一步。
trimethylamine N-oxide (TMAO) demethylase,Tdm
三甲胺N-氧化物(TMAO)脫甲基酶,Tdm
Together, our results provide novel insight into the role of Zn2+ and Fe2+
in the catalysis of TMAO demethylation by this unique oxygen-independent enzyme.
我們的結果提供了新穎的見解,通過這種獨特的不依賴氧的酶,Zn2+(鋅離子)和Fe2+(鐵二價離子)在TMAO脫甲基催化中的作用。
trimethylamine N-oxide (TMAO) demethylase , Tdm
三甲胺N-氧化物(TMAO)脫甲基酶,Tdm
Herein, we demonstrate that active Tdm has 1 molar equivalent of Zn2+
and 1 molar equivalent of non-haem Fe2+ .
在這裡,我們證明了活性Tdm具有1摩爾當量的Zn2+(鋅離子)和1摩爾當量的非血紅素Fe2+(鐵二價離子)。
儲存的鐵離子若要釋放,需要FMNH2(和維他命B2有關https://zh.wikipedia.org/zh-tw/黃素單核苷酸)、NADH(和維他命B3有關https://zh.wikipedia.org/zh-tw/菸鹼醯胺腺嘌呤二核苷酸
)或者維生素C的幫助,使三價鐵離子還原成二價鐵離子
小結1:
所以降解氧化三甲胺的第一步,需要鋅、鐵、維它命B2、B3或維它命C。
二、
dimethylamine monooxygenase
二甲胺單加氧酶
The enzyme, characterized from several bacterial species, is involved
in a pathway for the degradation of methylated amines. It is composed
of three subunits, one of which is a ferredoxin, and contains heme iron
and an FMN cofactor.
這個酵素參與了甲基化胺降解的途徑。 它由三個亞基組成,其中一個是鐵氧還原蛋白,
並包含血紅素鐵和FMN輔因子。
黃素單核苷酸(英語:Flavin mononucleotide,FMN)是一個由核黃素激酶自核黃素
(維生素B2)產生出來的生物分子
核黃素激酶(英語:riboflavin kinase),該酶催化的反應的底物為ATP和核黃素
,產物是ADP和黃素單核苷酸(FMN)。
CATALYZED by Riboflavin kinase (Mg2+)
核黃素激酶(Mg2+鎂離子)催化
小結2:
所以二甲胺單加氧酶需要鎂+維它命B2
三、
Amine Dehydrogenase (EC 1.4.99.3), also known as methylamine dehydrogenase (MADH),
is a tryptophan tryptophylquinone-dependent (TTQ-dependent) enzyme
胺脫氫酶(EC 1.4.99.3),也稱為甲胺脫氫酶(MADH),是一種依賴於色氨酸,
色氨酸醌的酶(依賴於TTQ的酶)
MauG is a c-type diheme enzyme that catalyzes the final three reactions in TTQ formation.
MauG是一種c型雙血紅素酶,可催化TTQ形成中的最後三個反應。
MauG is a c-type diheme enzyme that completes TTQ biosynthesis.
MauG是完成TTQ生物合成的c型雙血紅素酶。
富含色氨酸的蔬菜:
大豆,馬鈴薯,海藻,螺旋藻,利馬豆
The crystal structure of MauG surprisingly reveals the presence of a Ca2+ in proximity
to the two hemes [1].
MauG的晶體結構令人驚訝地揭示了在兩個血紅素附近存在Ca2+的現象[1]。
The Ca 2+ -depleted MauG is enzymatically inactive [2].
Ca2+去除的MauG在酶上沒有活性[2]。
小結3:
所以甲胺脫氫酶需要鈣、色胺酸
四、
In the first reaction of the serine pathway, formaldehyde reacts with glycine
to form L-serine. The reaction is catalyzed by EC 2.1.2.1,
glycine hydroxymethyltransferase (SHMT), an enzyme that uses THF as a cofactor.
在絲氨酸途徑的第一反應中,甲醛與【甘氨酸】反應形成L-絲氨酸。
該反應由EC 2.1.2.1甘氨酸羥甲基轉移酶(SHMT)催化,該酶使用THF
(Tetrahydrofolate四氫葉酸【vitamin B9】https://biocyc.org/compound?orgid=META&id=THF-GLU-N)
作為輔因子。
Glycine hydroxymethyltransferase 甘氨酸羥甲基轉移酶 2.1.2.1
cofactor輔因子
Tetrahydrofolate四氫葉酸【vitamin B9】
Metal compounds/salts
金屬化合物/鹽
Mg2+(鎂離子)activation啟動
Mn2+(錳離子)activation啟動
富含甘氨酸的蔬菜:
大豆、海苔(海藻)、扁豆、利馬豆
小結4:
所以甲醛的代謝,需要甘胺酸、葉酸、鎂或錳。
總結以上: